O Tokyo DisneySea tem um tema geral de exploração náutica. A ideia para o parque surgiu de uma proposta para construir um segundo parque temático no sul da Califórnia chamado de "DisneySeas", em Long Beach, California. No entanto, a ideia foi abandonada depois que a empresa passou a enfrentar problemas financeiros com o projeto da Euro Disney. Mais tarde a ideia foi passada para a Oriental Land Company para expandir seu resort. Ao contrário da Tokyo Disneyland, a intenção geral era criar um parque temático mais adulto, incluindo atrações mais rápidas e assustadoras e shows projetados para um público mais velho. Na época em que o Tokyo DisneySea abriu em 2001, seu conceito e projeto esteve em desenvolvimento na Walt Disney Imagineering por mais de 20 anos. Há sete áreas temáticas ou "ports of call". A entrada para o parque é o Mediterranean Harbor, que se abre para mais seis portos temáticos: American Waterfront, Lost River Delta, Port Discovery, Mermaid Lagoon, Arabian Coast, and Mysterious Island. Os dois símbolos do parque são o DisneySea AquaSphere – uma fonte de água com um modelo gigante da terra – na praça de entrada, e o vulcão gigante, Monte Prometheus, localizado no centro do parque. O Monte Prometheus e o Castelo da Cinderella, no Tokyo Disneyland, o outro parque no resort, têm exatamente a mesma altura. É considerado, pelos entusiastas de parques temáticos, o melhor parque temático do mundo. A Tokyo DisneySea se prepara para abrir Fantasy Springs, a maior expansão do resort até então, com três subáreas temáticas dedicadas à Frozen, Enrolados e Peter Pan.